二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)分別有哪些？

優(yōu)勢(shì)：能夠同時(shí)得到大量的序列數(shù)據(jù)，相比于一代測(cè)序技術(shù)，通量提高了成千上萬倍;單條序列成本非常低廉。

劣勢(shì)：序列讀長(zhǎng)較短，Illumina平臺(tái)為250-300bp，454平臺(tái)也只有500bp左右;由于建庫(kù)中利用了PCR富集序列，因此有一些含量較少的序列可能無法被大量擴(kuò)增，造成一些信息的丟失，且PCR過程中有一定概率會(huì)引入錯(cuò)配堿基。想要得到準(zhǔn)確和長(zhǎng)度較長(zhǎng)的拼接結(jié)果，需要測(cè)序的覆蓋率較高導(dǎo)致結(jié)果錯(cuò)誤較多和成本增加。 二代測(cè)序與Sanger測(cè)序相同嗎？上海哪里有二代測(cè)序技術(shù)

二代測(cè)序不同應(yīng)用場(chǎng)景下的速度有多快？

病原微生物檢測(cè)：一般來說，二代測(cè)序用于檢測(cè)病原微生物時(shí)，能夠在幾個(gè)小時(shí)到一天左右出結(jié)果。比如在快速檢測(cè)血液中的病原微生物時(shí)，通常可以在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)獲得檢測(cè)結(jié)果，相比傳統(tǒng)的血液培養(yǎng)方法，時(shí)間大幅縮短，傳統(tǒng)血液培養(yǎng)一般需要幾天到一周的時(shí)間 。

全基因組測(cè)序：如果是對(duì)人類全基因組進(jìn)行測(cè)序，以目前的技術(shù)水平，使用二代測(cè)序技術(shù)完成一個(gè)人的全基因組測(cè)序，一般需要 1-2 天左右的時(shí)間。而在十幾年前，人類全基因組測(cè)序計(jì)劃***完成時(shí)，耗費(fèi)了大量的時(shí)間和精力，相比之下二代測(cè)序技術(shù)的速度提升***。

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的時(shí)間相對(duì)較短，一般幾個(gè)小時(shí)內(nèi)可以完成對(duì)大量 RNA 分子的測(cè)序和初步數(shù)據(jù)分析，進(jìn)而快速了解基因在特定條件下的表達(dá)情況8. 湖南嘉安健達(dá)二代測(cè)序技術(shù)單細(xì)胞測(cè)序也是二代測(cè)序。

二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異①

**患者

優(yōu)勢(shì)：對(duì)于**患者，二代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性相對(duì)較高，在**的診斷、***及監(jiān)測(cè)等方面應(yīng)用***。比如肺*患者，通過檢測(cè)**組織或血液中的基因突變，可準(zhǔn)確找到如EGFR、ALK等驅(qū)動(dòng)基因突變，為靶向***提供依據(jù)，其準(zhǔn)確率通常在90%以上。在軟組織**中，二代測(cè)序能檢測(cè)到**組織的基因信息，包括突變基因、基因表達(dá)情況等，幫助醫(yī)生更準(zhǔn)確地診斷病情，并制定個(gè)性化的***方案。

局限性：腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性會(huì)影響檢測(cè)準(zhǔn)確性，若樣本中腫瘤細(xì)胞比例低或存在多種類型細(xì)胞，可能導(dǎo)致部分基因突變漏檢，影響對(duì)**基因組全貌的評(píng)估。此外，血液樣本中循環(huán)**DNA含量低且釋放不穩(wěn)定，也會(huì)使檢測(cè)結(jié)果存在波動(dòng)，影響準(zhǔn)確性

宏基因組二代測(cè)序，你了解多少？

宏基因組二代測(cè)序（mNGS）是一項(xiàng)覆蓋病原譜廣且高通量的檢測(cè)技術(shù)，已在臨床領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。對(duì)于血液病患者，病原mNGS通過對(duì)樣本快速高通量測(cè)序，可以獲得更準(zhǔn)確、相對(duì)無偏倚的病原信息，對(duì)病原診斷起到積極的作用，尤其對(duì)傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測(cè)未覆蓋到或檢測(cè)周期較長(zhǎng)、陽(yáng)性率較低的病原可提高檢出率。對(duì)于臨床相關(guān)樣本應(yīng)首先完善傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測(cè)，病理、無菌標(biāo)本培養(yǎng)仍然是診斷的金標(biāo)準(zhǔn)，病原mNGS是對(duì)傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測(cè)的有力補(bǔ)充和延展而非替代。病原mNGS的報(bào)告解讀應(yīng)充分評(píng)估檢出微生物的致病性、流行病學(xué)、生物信息學(xué)信息，同時(shí)在結(jié)合患者臨床特征的基礎(chǔ)上進(jìn)行綜合判斷。 二代測(cè)序是為了改進(jìn)一代測(cè)序通量過低的問題而出現(xiàn)的。

二代測(cè)序的操作流程有哪些？

1.DNA提取與質(zhì)檢

· 純凈、足量、質(zhì)量好的樣本DNA是檢測(cè)成功的基礎(chǔ)（可以來源于血漿、新鮮組織等）

2.DNA處理→文庫(kù)構(gòu)建

· 得到統(tǒng)一長(zhǎng)度區(qū)間+有接頭的DNA片段

· 步驟：DNA打斷→末端修復(fù)→片段篩選→加A尾→接頭連接→PCR

3.靶向捕獲

· 特定區(qū)域基因的定向檢測(cè)

4.上機(jī)測(cè)序

· 根據(jù)通量情況選擇測(cè)序儀

· 上樣后機(jī)器完成

5.數(shù)據(jù)分析

· 初級(jí)分析：光強(qiáng)數(shù)據(jù)（不同熒光標(biāo)記堿基）→序列信息（AGCT）

· 二級(jí)分析 多儀器自帶

· 三級(jí)分析 vcf文件 可diy 二代測(cè)序廣泛應(yīng)用于個(gè)性化醫(yī)學(xué)。靜安區(qū)二代測(cè)序檢測(cè)

二代測(cè)序通量大，可以產(chǎn)生上G的reads.上海哪里有二代測(cè)序技術(shù)

不同二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)的速度

Illumina 測(cè)序平臺(tái)：這是目前市場(chǎng)上應(yīng)用較為***的二代測(cè)序平臺(tái)之一，其測(cè)序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列，一次運(yùn)行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù)，通量可達(dá)數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長(zhǎng)，能夠滿足大規(guī)?；蚪M學(xué)研究和臨床檢測(cè)的需求。

Roche 454 測(cè)序平臺(tái)：Roche 454 測(cè)序系統(tǒng)的測(cè)序速度也較快，其特點(diǎn)是測(cè)序片段比較長(zhǎng)，高質(zhì)量的讀長(zhǎng)能達(dá)到 400bp 左右，一次運(yùn)行可以在 24 小時(shí)左右完成對(duì)一定數(shù)量樣本的測(cè)序。

BGISEQ 系列：華大智造的 BGISEQ 系列測(cè)序儀在速度上也有出色表現(xiàn)，如全球二代測(cè)序速度**快設(shè)備 E25 量產(chǎn)，為快速測(cè)序提供了有力支持 上海哪里有二代測(cè)序技術(shù)

嘉安健達(dá)醫(yī)學(xué)科技（上海）有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中，一直處在一個(gè)不斷銳意進(jìn)取，不斷制造創(chuàng)新的市場(chǎng)高度，多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價(jià)值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)**，成績(jī)讓我們喜悅，但不會(huì)讓我們止步，殘酷的市場(chǎng)磨煉了我們堅(jiān)強(qiáng)不屈的意志，和諧溫馨的工作環(huán)境，富有營(yíng)養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新，勇于進(jìn)取的無限潛力，嘉安健達(dá)醫(yī)學(xué)科技供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來，回首過去，我們不會(huì)因?yàn)槿〉昧艘稽c(diǎn)點(diǎn)成績(jī)而沾沾自喜，相反的是面對(duì)競(jìng)爭(zhēng)越來越激烈的市場(chǎng)氛圍，我們更要明確自己的不足，做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備，要不畏困難，激流勇進(jìn)，以一個(gè)更嶄新的精神面貌迎接大家，共同走向輝煌回來！